Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX5P78411 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX5P78411 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX5P78411 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX5P78411 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX5P78411 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX5P78411 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX5P78411 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX5P78411 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX5P78411 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX5P78411 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX5P78411 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX5P78411 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX5P78411 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX5P78411 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX5P78411 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX5P78411 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX5P78411 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX5P78411 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX5P78411 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX5P78411 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX5P78411 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX5P78411 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX5P78411 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX5P78411 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX5P78411 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX5P78411 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX5P78411 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX5P78411 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX5P78411 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms