Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4BP68371 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUBB4BP68371 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms