Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACTA1P68133 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTA1P68133 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms