Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
RPS29P62273 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
RPS29P62273 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
RPS29P62273 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
RPS29P62273 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
RPS29P62273 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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