Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DCDC1P59894 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms