Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHMP4BP1P59074 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP4BP1P59074 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms