Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RIPK4P57078 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RIPK4P57078 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RIPK4P57078 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms