Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCL23P55773 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCL23P55773 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL23P55773 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL23P55773 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL23P55773 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL23P55773 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL23P55773 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL23P55773 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL23P55773 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL23P55773 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL23P55773 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL23P55773 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL23P55773 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL23P55773 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCL23P55773 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL23P55773 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL23P55773 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL23P55773 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL23P55773 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL23P55773 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL23P55773 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL23P55773 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL23P55773 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL23P55773 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL23P55773 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL23P55773 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCL23P55773 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCL23P55773 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCL23P55773 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL23P55773 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL23P55773 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL23P55773 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL23P55773 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL23P55773 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL23P55773 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL23P55773 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL23P55773 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL23P55773 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL23P55773 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL23P55773 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL23P55773 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL23P55773 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCL23P55773 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL23P55773 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL23P55773 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL23P55773 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL23P55773 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL23P55773 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL23P55773 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL23P55773 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL23P55773 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL23P55773 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL23P55773 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL23P55773 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL23P55773 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCL23P55773 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCL23P55773 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL23P55773 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL23P55773 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL23P55773 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL23P55773 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL23P55773 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL23P55773 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL23P55773 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL23P55773 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCL23P55773 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms