Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRPF1P55201 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRPF1P55201 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms