Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4P55056 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4P55056 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4P55056 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4P55056 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4P55056 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4P55056 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4P55056 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4P55056 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4P55056 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4P55056 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4P55056 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4P55056 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4P55056 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4P55056 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4P55056 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4P55056 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4P55056 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4P55056 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOC4P55056 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4P55056 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms