Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRLP54845 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRLP54845 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NRLP54845 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRLP54845 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRLP54845 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRLP54845 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRLP54845 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRLP54845 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NRLP54845 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRLP54845 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRLP54845 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRLP54845 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRLP54845 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRLP54845 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRLP54845 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NRLP54845 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRLP54845 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRLP54845 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NRLP54845 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRLP54845 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRLP54845 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NRLP54845 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NRLP54845 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRLP54845 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRLP54845 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRLP54845 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRLP54845 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRLP54845 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRLP54845 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NRLP54845 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRLP54845 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRLP54845 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRLP54845 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRLP54845 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRLP54845 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NRLP54845 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRLP54845 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NRLP54845 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NRLP54845 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NRLP54845 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRLP54845 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRLP54845 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRLP54845 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRLP54845 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRLP54845 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRLP54845 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRLP54845 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRLP54845 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NRLP54845 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRLP54845 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRLP54845 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRLP54845 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NRLP54845 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRLP54845 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NRLP54845 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NRLP54845 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRLP54845 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRLP54845 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRLP54845 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRLP54845 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRLP54845 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NRLP54845 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NRLP54845 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRLP54845 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRLP54845 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NRLP54845 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms