Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2KP53803 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.06■□□□□ 0
POLR2KP53803 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2KP53803 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2KP53803 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2KP53803 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
POLR2KP53803 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
POLR2KP53803 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
POLR2KP53803 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
POLR2KP53803 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
POLR2KP53803 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
POLR2KP53803 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms