Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP2S1P53680 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AP2S1P53680 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms