Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3M2P53677 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP3M2P53677 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms