Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK2P53671 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms