Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARFIP1P53367 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ARFIP1P53367 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms