Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EFNA5P52803 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFNA5P52803 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms