Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HK3P52790 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HK3P52790 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HK3P52790 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HK3P52790 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HK3P52790 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HK3P52790 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HK3P52790 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HK3P52790 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HK3P52790 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HK3P52790 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HK3P52790 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HK3P52790 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HK3P52790 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HK3P52790 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HK3P52790 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HK3P52790 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HK3P52790 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HK3P52790 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HK3P52790 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HK3P52790 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HK3P52790 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HK3P52790 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HK3P52790 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HK3P52790 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HK3P52790 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HK3P52790 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HK3P52790 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HK3P52790 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HK3P52790 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HK3P52790 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HK3P52790 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HK3P52790 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HK3P52790 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HK3P52790 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HK3P52790 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HK3P52790 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HK3P52790 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HK3P52790 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HK3P52790 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HK3P52790 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HK3P52790 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HK3P52790 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HK3P52790 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HK3P52790 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HK3P52790 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HK3P52790 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HK3P52790 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HK3P52790 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HK3P52790 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HK3P52790 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HK3P52790 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HK3P52790 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HK3P52790 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HK3P52790 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HK3P52790 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HK3P52790 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HK3P52790 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HK3P52790 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HK3P52790 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HK3P52790 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HK3P52790 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HK3P52790 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HK3P52790 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HK3P52790 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HK3P52790 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HK3P52790 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HK3P52790 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HK3P52790 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HK3P52790 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HK3P52790 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HK3P52790 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HK3P52790 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HK3P52790 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HK3P52790 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HK3P52790 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HK3P52790 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HK3P52790 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HK3P52790 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HK3P52790 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms