Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC38.64■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
SMARCA4P51532 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SMARCA4P51532 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
SMARCA4P51532 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms