Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BCAMP50895 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BCAMP50895 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BCAMP50895 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAMP50895 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAMP50895 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAMP50895 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAMP50895 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAMP50895 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAMP50895 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAMP50895 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAMP50895 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAMP50895 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAMP50895 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAMP50895 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAMP50895 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAMP50895 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAMP50895 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAMP50895 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAMP50895 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAMP50895 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAMP50895 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAMP50895 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAMP50895 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAMP50895 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAMP50895 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAMP50895 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAMP50895 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAMP50895 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAMP50895 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAMP50895 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAMP50895 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAMP50895 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAMP50895 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAMP50895 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAMP50895 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAMP50895 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAMP50895 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAMP50895 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAMP50895 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAMP50895 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAMP50895 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAMP50895 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAMP50895 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAMP50895 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCAMP50895 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BCAMP50895 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BCAMP50895 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BCAMP50895 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BCAMP50895 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BCAMP50895 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BCAMP50895 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BCAMP50895 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BCAMP50895 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BCAMP50895 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BCAMP50895 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BCAMP50895 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BCAMP50895 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BCAMP50895 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BCAMP50895 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAMP50895 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAMP50895 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAMP50895 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAMP50895 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAMP50895 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAMP50895 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAMP50895 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAMP50895 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAMP50895 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAMP50895 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAMP50895 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAMP50895 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAMP50895 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAMP50895 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCAMP50895 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAMP50895 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAMP50895 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAMP50895 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAMP50895 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAMP50895 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAMP50895 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAMP50895 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms