Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERFP50548 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERFP50548 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERFP50548 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERFP50548 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERFP50548 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERFP50548 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERFP50548 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERFP50548 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERFP50548 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERFP50548 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERFP50548 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERFP50548 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERFP50548 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERFP50548 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERFP50548 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERFP50548 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ERFP50548 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERFP50548 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERFP50548 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERFP50548 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERFP50548 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERFP50548 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERFP50548 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERFP50548 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERFP50548 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERFP50548 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERFP50548 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERFP50548 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERFP50548 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERFP50548 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERFP50548 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERFP50548 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERFP50548 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERFP50548 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERFP50548 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERFP50548 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms