Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK2P49760 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK2P49760 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK2P49760 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK2P49760 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK2P49760 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK2P49760 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK2P49760 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK2P49760 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK2P49760 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK2P49760 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK2P49760 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK2P49760 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK2P49760 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK2P49760 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLK2P49760 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK2P49760 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK2P49760 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK2P49760 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK2P49760 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK2P49760 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK2P49760 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK2P49760 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK2P49760 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK2P49760 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLK2P49760 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK2P49760 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK2P49760 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK2P49760 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK2P49760 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK2P49760 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK2P49760 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK2P49760 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK2P49760 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK2P49760 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK2P49760 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK2P49760 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK2P49760 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK2P49760 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK2P49760 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLK2P49760 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK2P49760 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK2P49760 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK2P49760 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK2P49760 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK2P49760 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK2P49760 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK2P49760 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLK2P49760 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLK2P49760 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLK2P49760 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLK2P49760 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLK2P49760 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLK2P49760 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLK2P49760 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLK2P49760 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLK2P49760 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLK2P49760 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLK2P49760 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLK2P49760 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK2P49760 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK2P49760 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK2P49760 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLK2P49760 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms