Protein–RNA interactions for Protein: P49756

RBM25, RNA-binding protein 25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM25P49756 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM25P49756 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM25P49756 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM25P49756 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM25P49756 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM25P49756 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM25P49756 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM25P49756 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM25P49756 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM25P49756 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM25P49756 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM25P49756 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM25P49756 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM25P49756 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM25P49756 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM25P49756 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM25P49756 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM25P49756 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM25P49756 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM25P49756 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM25P49756 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM25P49756 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM25P49756 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM25P49756 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM25P49756 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM25P49756 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM25P49756 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM25P49756 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBM25P49756 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM25P49756 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM25P49756 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM25P49756 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM25P49756 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM25P49756 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM25P49756 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM25P49756 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM25P49756 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBM25P49756 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM25P49756 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM25P49756 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM25P49756 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM25P49756 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM25P49756 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM25P49756 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM25P49756 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM25P49756 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM25P49756 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBM25P49756 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM25P49756 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM25P49756 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM25P49756 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM25P49756 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM25P49756 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM25P49756 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM25P49756 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM25P49756 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM25P49756 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM25P49756 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM25P49756 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM25P49756 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM25P49756 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM25P49756 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBM25P49756 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM25P49756 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM25P49756 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM25P49756 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM25P49756 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM25P49756 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM25P49756 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM25P49756 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM25P49756 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBM25P49756 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBM25P49756 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM25P49756 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM25P49756 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM25P49756 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM25P49756 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM25P49756 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM25P49756 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM25P49756 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM25P49756 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM25P49756 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM25P49756 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBM25P49756 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms