Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMD8P48556 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMD8P48556 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD8P48556 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD8P48556 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD8P48556 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD8P48556 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD8P48556 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD8P48556 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMD8P48556 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms