Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GRIA4P48058 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GRIA4P48058 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms