Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GABRB2P47870 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRB2P47870 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms