Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCAMP43121 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCAMP43121 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCAMP43121 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCAMP43121 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCAMP43121 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCAMP43121 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MCAMP43121 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCAMP43121 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCAMP43121 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCAMP43121 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCAMP43121 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCAMP43121 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCAMP43121 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCAMP43121 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCAMP43121 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCAMP43121 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCAMP43121 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCAMP43121 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCAMP43121 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCAMP43121 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCAMP43121 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCAMP43121 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCAMP43121 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MCAMP43121 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MCAMP43121 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCAMP43121 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCAMP43121 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCAMP43121 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCAMP43121 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCAMP43121 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCAMP43121 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCAMP43121 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCAMP43121 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCAMP43121 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCAMP43121 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCAMP43121 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCAMP43121 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCAMP43121 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCAMP43121 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCAMP43121 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCAMP43121 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCAMP43121 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCAMP43121 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCAMP43121 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCAMP43121 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCAMP43121 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCAMP43121 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCAMP43121 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCAMP43121 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCAMP43121 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCAMP43121 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCAMP43121 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MCAMP43121 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCAMP43121 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCAMP43121 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCAMP43121 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCAMP43121 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCAMP43121 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCAMP43121 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCAMP43121 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCAMP43121 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCAMP43121 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCAMP43121 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCAMP43121 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCAMP43121 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCAMP43121 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCAMP43121 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCAMP43121 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCAMP43121 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCAMP43121 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCAMP43121 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCAMP43121 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCAMP43121 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCAMP43121 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCAMP43121 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCAMP43121 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCAMP43121 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCAMP43121 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCAMP43121 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCAMP43121 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCAMP43121 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCAMP43121 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCAMP43121 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCAMP43121 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCAMP43121 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCAMP43121 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCAMP43121 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MCAMP43121 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MCAMP43121 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCAMP43121 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCAMP43121 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCAMP43121 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCAMP43121 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCAMP43121 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCAMP43121 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCAMP43121 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCAMP43121 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCAMP43121 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MCAMP43121 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms