Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP2P42575 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP2P42575 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP2P42575 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP2P42575 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP2P42575 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP2P42575 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP2P42575 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP2P42575 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP2P42575 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP2P42575 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP2P42575 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP2P42575 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP2P42575 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP2P42575 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP2P42575 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP2P42575 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP2P42575 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP2P42575 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP2P42575 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CASP2P42575 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP2P42575 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP2P42575 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP2P42575 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP2P42575 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP2P42575 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP2P42575 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP2P42575 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP2P42575 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP2P42575 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP2P42575 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CASP2P42575 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CASP2P42575 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CASP2P42575 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP2P42575 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP2P42575 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP2P42575 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP2P42575 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP2P42575 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CASP2P42575 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms