Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF9P41273 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF9P41273 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms