Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX1P40424 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX1P40424 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX1P40424 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX1P40424 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX1P40424 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX1P40424 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX1P40424 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX1P40424 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX1P40424 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX1P40424 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX1P40424 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX1P40424 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX1P40424 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX1P40424 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX1P40424 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX1P40424 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX1P40424 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX1P40424 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX1P40424 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX1P40424 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX1P40424 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX1P40424 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX1P40424 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX1P40424 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX1P40424 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX1P40424 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX1P40424 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX1P40424 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX1P40424 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX1P40424 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX1P40424 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX1P40424 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX1P40424 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX1P40424 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX1P40424 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX1P40424 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX1P40424 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX1P40424 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX1P40424 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX1P40424 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX1P40424 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX1P40424 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX1P40424 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX1P40424 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX1P40424 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX1P40424 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PBX1P40424 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PBX1P40424 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX1P40424 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX1P40424 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX1P40424 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX1P40424 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX1P40424 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX1P40424 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX1P40424 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX1P40424 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX1P40424 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX1P40424 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX1P40424 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX1P40424 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX1P40424 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX1P40424 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX1P40424 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX1P40424 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX1P40424 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX1P40424 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms