Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL3P39023 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPL3P39023 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL3P39023 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL3P39023 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL3P39023 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL3P39023 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL3P39023 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL3P39023 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL3P39023 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL3P39023 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL3P39023 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL3P39023 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL3P39023 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL3P39023 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPL3P39023 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL3P39023 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL3P39023 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL3P39023 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL3P39023 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL3P39023 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL3P39023 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL3P39023 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL3P39023 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPL3P39023 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL3P39023 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL3P39023 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL3P39023 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL3P39023 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL3P39023 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL3P39023 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL3P39023 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL3P39023 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL3P39023 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL3P39023 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL3P39023 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL3P39023 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL3P39023 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL3P39023 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPL3P39023 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPL3P39023 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPL3P39023 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPL3P39023 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL3P39023 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL3P39023 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL3P39023 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL3P39023 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL3P39023 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL3P39023 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPL3P39023 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms