Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FDFT1P37268 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms