Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LTBRP36941 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBRP36941 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBRP36941 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBRP36941 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBRP36941 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBRP36941 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBRP36941 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBRP36941 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBRP36941 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBRP36941 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBRP36941 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBRP36941 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBRP36941 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBRP36941 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LTBRP36941 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LTBRP36941 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBRP36941 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBRP36941 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBRP36941 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBRP36941 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBRP36941 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBRP36941 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBRP36941 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBRP36941 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBRP36941 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBRP36941 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBRP36941 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBRP36941 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBRP36941 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBRP36941 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LTBRP36941 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LTBRP36941 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBRP36941 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBRP36941 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBRP36941 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBRP36941 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBRP36941 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBRP36941 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBRP36941 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBRP36941 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBRP36941 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBRP36941 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBRP36941 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBRP36941 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBRP36941 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBRP36941 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LTBRP36941 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LTBRP36941 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms