Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CHRNA7P36544 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNA7P36544 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms