Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM23P36406 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms