Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX5P35711 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX5P35711 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX5P35711 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX5P35711 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX5P35711 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX5P35711 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX5P35711 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX5P35711 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX5P35711 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX5P35711 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX5P35711 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX5P35711 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX5P35711 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX5P35711 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX5P35711 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX5P35711 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX5P35711 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX5P35711 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX5P35711 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX5P35711 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX5P35711 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX5P35711 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX5P35711 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX5P35711 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX5P35711 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX5P35711 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX5P35711 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX5P35711 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX5P35711 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX5P35711 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX5P35711 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX5P35711 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX5P35711 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX5P35711 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX5P35711 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX5P35711 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX5P35711 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX5P35711 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX5P35711 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX5P35711 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX5P35711 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX5P35711 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX5P35711 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX5P35711 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX5P35711 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX5P35711 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX5P35711 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX5P35711 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX5P35711 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX5P35711 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX5P35711 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX5P35711 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX5P35711 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX5P35711 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX5P35711 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX5P35711 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX5P35711 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX5P35711 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX5P35711 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX5P35711 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX5P35711 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX5P35711 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX5P35711 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX5P35711 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX5P35711 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX5P35711 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX5P35711 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX5P35711 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX5P35711 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX5P35711 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX5P35711 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX5P35711 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX5P35711 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX5P35711 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX5P35711 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX5P35711 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX5P35711 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX5P35711 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX5P35711 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX5P35711 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms