Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXD12P35452 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD12P35452 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms