Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RORAP35398 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RORAP35398 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RORAP35398 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RORAP35398 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RORAP35398 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RORAP35398 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RORAP35398 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RORAP35398 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RORAP35398 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RORAP35398 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RORAP35398 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RORAP35398 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RORAP35398 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RORAP35398 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RORAP35398 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RORAP35398 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RORAP35398 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RORAP35398 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RORAP35398 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RORAP35398 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RORAP35398 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RORAP35398 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RORAP35398 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RORAP35398 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RORAP35398 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms