Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC1P35251 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC1P35251 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC1P35251 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC1P35251 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC1P35251 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC1P35251 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC1P35251 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC1P35251 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC1P35251 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC1P35251 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC1P35251 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC1P35251 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC1P35251 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC1P35251 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC1P35251 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC1P35251 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC1P35251 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC1P35251 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC1P35251 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC1P35251 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC1P35251 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC1P35251 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC1P35251 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC1P35251 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC1P35251 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFC1P35251 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFC1P35251 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFC1P35251 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RFC1P35251 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC1P35251 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC1P35251 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC1P35251 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC1P35251 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC1P35251 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC1P35251 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC1P35251 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC1P35251 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC1P35251 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC1P35251 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFC1P35251 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC1P35251 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC1P35251 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC1P35251 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC1P35251 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC1P35251 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC1P35251 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC1P35251 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC1P35251 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC1P35251 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC1P35251 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC1P35251 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC1P35251 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC1P35251 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFC1P35251 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC1P35251 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC1P35251 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC1P35251 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC1P35251 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC1P35251 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC1P35251 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC1P35251 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC1P35251 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC1P35251 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC1P35251 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC1P35251 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC1P35251 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFC1P35251 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC1P35251 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC1P35251 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC1P35251 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC1P35251 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC1P35251 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC1P35251 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC1P35251 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC1P35251 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC1P35251 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC1P35251 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFC1P35251 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC1P35251 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC1P35251 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC1P35251 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC1P35251 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC1P35251 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC1P35251 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC1P35251 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC1P35251 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC1P35251 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC1P35251 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC1P35251 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC1P35251 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC1P35251 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC1P35251 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFC1P35251 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC1P35251 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC1P35251 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC1P35251 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC1P35251 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC1P35251 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFC1P35251 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms