Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTNNA1P35221 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTNNA1P35221 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms