Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ABCC1P33527 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ABCC1P33527 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC1P33527 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms