Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCKARP32238 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CCKARP32238 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCKARP32238 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCKARP32238 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCKARP32238 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCKARP32238 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCKARP32238 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCKARP32238 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCKARP32238 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCKARP32238 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCKARP32238 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCKARP32238 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCKARP32238 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCKARP32238 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCKARP32238 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCKARP32238 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCKARP32238 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCKARP32238 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCKARP32238 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCKARP32238 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCKARP32238 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms