Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXA7P31268 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXA7P31268 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms