Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNGA1P29973 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNGA1P29973 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms