Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMOD1P29536 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMOD1P29536 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMOD1P29536 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms