Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCAP28676 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCAP28676 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCAP28676 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GCAP28676 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCAP28676 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCAP28676 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCAP28676 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCAP28676 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCAP28676 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCAP28676 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCAP28676 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCAP28676 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCAP28676 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCAP28676 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCAP28676 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCAP28676 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCAP28676 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCAP28676 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCAP28676 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCAP28676 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GCAP28676 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GCAP28676 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GCAP28676 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GCAP28676 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCAP28676 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GCAP28676 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GCAP28676 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCAP28676 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GCAP28676 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCAP28676 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCAP28676 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCAP28676 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCAP28676 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCAP28676 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GCAP28676 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GCAP28676 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GCAP28676 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GCAP28676 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GCAP28676 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GCAP28676 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GCAP28676 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCAP28676 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCAP28676 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCAP28676 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCAP28676 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GCAP28676 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCAP28676 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCAP28676 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GCAP28676 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCAP28676 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCAP28676 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCAP28676 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GCAP28676 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GCAP28676 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GCAP28676 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms