Protein–RNA interactions for Protein: P27482

CALML3, Calmodulin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML3P27482 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALML3P27482 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALML3P27482 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALML3P27482 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALML3P27482 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALML3P27482 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALML3P27482 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALML3P27482 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALML3P27482 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML3P27482 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML3P27482 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML3P27482 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML3P27482 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML3P27482 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML3P27482 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML3P27482 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML3P27482 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML3P27482 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML3P27482 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML3P27482 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML3P27482 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML3P27482 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML3P27482 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML3P27482 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML3P27482 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML3P27482 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML3P27482 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML3P27482 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML3P27482 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML3P27482 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML3P27482 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML3P27482 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML3P27482 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML3P27482 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML3P27482 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML3P27482 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML3P27482 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML3P27482 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML3P27482 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML3P27482 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML3P27482 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML3P27482 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML3P27482 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML3P27482 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML3P27482 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML3P27482 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML3P27482 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML3P27482 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML3P27482 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML3P27482 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML3P27482 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML3P27482 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML3P27482 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML3P27482 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML3P27482 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML3P27482 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML3P27482 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML3P27482 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML3P27482 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML3P27482 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML3P27482 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML3P27482 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML3P27482 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML3P27482 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML3P27482 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML3P27482 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML3P27482 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML3P27482 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML3P27482 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML3P27482 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML3P27482 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML3P27482 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML3P27482 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML3P27482 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML3P27482 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML3P27482 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML3P27482 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML3P27482 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML3P27482 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML3P27482 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML3P27482 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML3P27482 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALML3P27482 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALML3P27482 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALML3P27482 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALML3P27482 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALML3P27482 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML3P27482 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML3P27482 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML3P27482 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML3P27482 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML3P27482 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML3P27482 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML3P27482 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML3P27482 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML3P27482 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML3P27482 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML3P27482 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML3P27482 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML3P27482 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms