Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDELR1P24390 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDELR1P24390 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms