Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRDP23468 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRDP23468 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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