Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRBP23467 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRBP23467 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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